داستان از جایی آغاز می‌شود که پسر جوانی به نام آلن یک جعبه بازی پیدا می‌کند و با کمک دختر همسایه سارا بازی را آغاز می‌کند. اما پس از آغاز بازی آلن به طرز عجیبی در حباب وسط صفحه جذب می‌شود و سارا در حالی که توسط خفاش‌ها محاصره شده فرار می‌کند. 26 سال از آن زمان می‌گذرد تا خانواده شپرد به آن خانه نقل مکان می‌کنند و با پیدا کردن جومانجی بازی را از سر می‌گیرند. این موضوع باعث ملحق شدن آلن پریش به آنها می‌شود اما آنها برای ادامه بازی به یک همبازی دیگر نیاز دارند و برای همین به سراغ سارا ویتل می‌روند تا بازی را باهم دنبال کنند. حالا نوبت شماست تا یک بار دیگر این بازی را انجام دهید و وارد جنگل اسرار آمیز شوید. پس مواظب موجودات و اتفاقاتی که در این بازی می افتد باشید و این رو هم بدونید اگه بازی رو شروع کردید محکوم به تمام کردون اون هستین.