اخوت اسسین ها قرن ها در جنگی پنهان با دشمنان قسم خورده اش ، محفل معبدی ها به سر برده است. معبدیون به دنبال خلق جهانی کامل با استفاده از تکه های عدن – آثار باستانی پیشرفته ای که از نژادی پیشرو به جا مانده است – هستند که با نظم و اتحاد کنترل میشوند. این موضوع با آرمان های اخوت اسسین ها که برای حفظ آزادی و اراده ی بشریت میجنگند در تضاد است. شارلوت دلا کروز – فردی تازه وارد در این دنیای تیره و تار – به مهره ای حیاتی در اخوت اسسین ها تبدیل شده است.