سازمان انتشارات پژوهشگاه فرهنگ و اندیشه اسلامی کتاب تاریخ اسلام در آسیای مرکزی تا حمله مغول از چهار بخش تشکیل شده است: *بخش اول: آسیای مرکزی قبل از اسلام. فصل اول: آسیای مرکزی یا آسیای میانه؛ فصل دوم: باستان شناسی خراسان و ماوراءالنهر؛ فصل سوم: خراسان بزرگ یا ولایات شرقی ایران؛ فصل چهارم: آسیای مرکزی قبل از ورود اسلام؛ فصل پنجم: حکومت های مستقل در آسیای مرکزی قبل از اسلام. *بخش دوم: اسلام در آسیای مرکزی. فصل اول: نحوه استقرار اعراب مسلمان در ایران؛ فصل دوم: آسیای مرکزی در دوره بنی امیه؛ فصل سوم: حرکت های مبارزه بر ضد بنی امیه در خراسان و ماوراءالنهر؛ فصل چهارم: شورش حارث بن سریج در خراسان (116-128هـ). *بخش سوم: آسیای مرکزی در دوره حکومت عباسیان تا روی کارآمدن طاهریان. فصل اول: واگذاری ولایات به والیان در دوره عباسیان تا حکومت طاهریان؛ فصل دوم: ترکان و حکومت عباسیان؛ فصل سوم: جنبش های دوره اول عباسی تا روی کارآمدن طاهریان در خراسان و ماوراءالنهر؛ فصل چهارم: فرقه های اسلامی و تصوف و گسترش اسلام در خراسان و ماوراءالنهر؛ فصل پنجم: خراسان و ماوراءالنهر در دوره حکومت های متقارن. *بخش چهارم: قره خانیان: اولین دولت ترک مسلمان در ماوراءالنهر. فصل اول: خراسان و ماوراءالنهر در دوره غزنویان؛ فصل دوم: خراسان و ماوراءالنهر در دوره سلجوقیان؛ فصل سوم: خراسان و ماوراءالنهر در دوره خوارزمشاهیان.