مهم‌ترین نکته در کاشت گوجه فرنگی به روش بذر این است که بذرها تا زمانی که تبدیل به نشاء شوند باید در دمای ثابت قرار گیرند. بنابرین محیطی مانند خانه مناسب کاشت بذر گوجه فرنگی است.گلدان یا سینی نشاء یا حتی لیوان یکبار مصرف را می‌توانید با خاک مورد نظر پر کنید، سوراخ‌هایی با عمق نیم سانتی متر ایجاد کرده و درون این حفره‌ها تعدادی بذر بریزید و روی آن‌ها را با کمی خاک بپوشانید؛ سپس آبیاری کرده(اسپری) و روی آن نایلون پلاستیکی کشیده(و تا جوانه زدن مرطوب نگه‌دارید) بعد از حدود ده روز شاهد اولین جوانه‌ها خواهید بود سپس نایلون را بردارید.